Trung tâm Công nghệ Khí sinh học là tổ chức tập hợp, đoàn kết các cán bộ khoa học và công nghệ để thực hiện các hoạt động khoa học và công nghệ nhằm góp phần xây dựng một ngành công nghệ khí sinh học Việt Nam theo hướng công nghiệp hoá và thương mại hoá phục vụ sự nghiệp phát triển kinh tế - xã hội, bảo vệ môi trường, phát triển năng lượng bền vững, phát triển nông nghiệp sinh thái, nâng cao mức sống của nhân dân và xoá đói giảm nghèo.